Los primeros judíos se establecieron en Šiauliai durante el siglo XVII. A principios del siglo XX constituían más de la mitad de la población de la ciudad.
Antes de la Segunda Guerra Mundial habitaban Šiauliai alrededor de 6.600 judíos. En junio de 1941, cuando la ciudad fue ocupada por fuerzas alemanas, los alemanes y lituanos asesinaron a centenares de judíos de la ciudad en una serie de masacres perpetradas en un bosque cercano. A fines de aquel año se establecieron dos guetos y se siguieron ejecutando operaciones de exterminio. Cientos de judíos encontraron refugio temporal de las matanzas en campos de trabajo forzado. Al mismo tiempo la comunidad judía confinada en el gueto se esforzaba para mantener actividades culturales dentro del mismo.
Al acercarse el Ejército Rojo el gueto de Šiauliai fue liquidado. La mayoría de los que quedaban en el gueto y en los campos de trabajo fueron deportados hacia el oeste, a campos de trabajo en Polonia y Alemania. Solamente unos pocos sobrevivieron.
Después del Holocausto regresaron a Šiauliai algunos cientos de judíos. Algunas decenas habían sobrevivido en zonas ocupadas por los nazis: la mayoría había huido a la Unión Soviética antes del comienzo de la ocupación nazi. Actualmente todavía viven en la ciudad algunos cientos de judíos.
La comunidad judía de Šiauliai antes del Holocausto
La ocupación alemana y las primeras redadas
El gueto de Šiauliai
