פיוטר בוּדניק נולד בכפר קצ'נובקה, בן להוריו יאן ואליזבטה ואח למריה, יוזף ומישקו. ברשות ההורים הייתה חווה חקלאית.
במרחק ארבעה בתים ממשפחת בודניק הקתולית התגוררה משפחת הלרייך היהודית, שעימה נמנו פישל, שהידר במצוות הדת וניהל חנות מכולת קטנה, רעייתו פאני וארבעת ילדיהם אדלה, אסתר, זאב ויוסף. בין שתי המשפחות שררה ידידות עוד מימי פרעות פְֶּטליוּרָה שלאחר מלחמת העולם הראשונה, כאשר יאן בודניק הציל את חייו של שכנו פישל הלרייך. בכפרו נודע יאן בודניק בכינוי "דודם של היהודים".
כשהגרמנים כבשו את האזור, נשלחו יהודי המקום, כולל משפחת הלרייך, לגטו סקלט. ב-1942, כשהגרמנים החלו בשורת אקציות, סיכן פיוטר את חייו ונכנס לגטו כדי לחלץ את אדלה, אסתר וזאב. מכיוון שלזאב הקטן לא עמדו כוחותיו והוא לא היה יכול לצעוד, נשא אותו פיוטר על ידיו. ביודעו שהוריו המבוגרים יתנגדו
להסתרת הילדים, שמר פיוטר את נוכחותם בסוד מפניהם. לאחר שהכין להם מקום מסתור בבית חוץ בחוותו, טיפל פיוטר לבדו בשלושת הילדים הצעירים. על משימתו הקשתה העובדה שהיה עליו להסתיר את הימצאותם מהוריו. למרות זאת, חשדה אמו של פיוטר שהוא מסייע ליהודים וניסתה להניאו מכך, ללא הצלחה.
כדי לכלכלם ולקיימם, לקח פיוטר אוכל מביתו ומכר את תוצרת החווה - תבואה ותפוחי אדמה - בשוק, ללא ידיעת הוריו. בכסף שקיבל היה קונה אוכל לילדי משפחת הלרייך. אף על פי שהגרמנים ועוזריהם האוקראינים פשטו מעת לעת על הכפר בחיפוש אחר יהודים, הם מעולם לא גילו את מקום המסתור של הילדים. לאחר שאסתר וזאב חלו בטיפוס עקב התנאים ההיגייניים הקשים במסתור, גדלה סכנת הגילוי, ולפיוטר לא נותרה ברירה אלא להעבירם לבונקר שאותו חפר בעצמו בשדה מרוחק. את אסתר, שבשל מחלתה לא יכלה ללכת והכרתה הייתה מטושטשת, נשא פיוטר על ידיו בכפור, בבוץ ובשלג אל המסתור. כמה ימים אחר כך נדבק פיוטר עצמו בטיפוס. לאחר שחלה, הסתבכה מחלתו והוא חלה בדלקת קרום המוח ומצבו היה אנוש. ילדי הלרייך שרדו אך בקושי את תקופת מחלתו מבלי שהגיש להם סיוע ומזון. לאחר 18 חודשי מחבוא שבהם סיכן פיוטר בודניק את חייו ללא הרף וללא חת, שוחררו האזור וילדי משפחת הלרייך בקיץ 1944.
לאחר המלחמה התחתן פיוטר עם אדלה, שאותה הציל. עקב אי היציבות הפוליטית באזור שהביאה עימה תנועת אוכלוסין, נדדו בני הזוג לברסלאו (ורוצלאב) שבמערב פולין, שם נולדו ילדיהם. אדלה עבדה בהנהלת חשבונות במפעל למדי מים, ופיוטר עבד בחנות למוצרי חשמל. ב-1957 עלתה משפחת בודניק לישראל במסגרת "עליית גומולקה", כשהם מפליגים באונייה. על הרציף בנמל חיפה המתין להם זאב הלרייך ובידו מנחת ברכה – שקית ענבים מתוקים. פיוטר ומשפחתו הצטרפו לאסתר ולזאב הרלייך, שהגיעו לישראל במסגרת ''עליית הנוער'' ב-1948. את ביתם ואת עתידם קבעו בכפר ורבורג, שם ייסד פיוטר משק חקלאי מצליח ושם גם נולדה בתם השלישית.
פיוטר בודניק היה אהוב על הבריות ואהב אנשים. הוא היה איש אדמה צנוע שחי במדינת ישראל בתחושת שייכות מלאה ובהכרה שהמדינה אפשרה לו ולמשפחתו לחיות חיים מלאים כבני חורין.
ב-18 באוקטובר 1966 הכיר יד ושם בפיוטר בודניק הנועז ורב התושייה כחסיד אומות העולם.
ב-26 בספטמבר 2002, והוא כבן 81, הלך פיוטר בודניק לעולמו. הוא הובא למנוחות בבית העלמין בכפר ורבורג.