В ноябре немцы разделили население гетто на две группы: работоспособные евреи были отправлены в «малое гетто», в то время как нетрудоспособные остались в «большом гетто». «Большое гетто» было ликвидировано в конце ноября – начале декабря 1941 года, в ходе этой операции около 20 000 евреев были убиты и похоронены в Румбульском лесу. В первой половине 1942 года 16.000 евреев были привезены с территории Рейха в «большое гетто». Позднее 14.000 из них были уничтожены.
В начале 1942 года в гетто было организовано подполье. В течение того же года участники подполья попытались совершить побег из гетто и перебраться к партизанам. Их обнаружили и большинство расстреляли. Кроме того, в качестве ответной меры, многие были убиты лишь по подозрению в связях с подпольем.
В ноябре 1942 года «малое» и «большое» гетто были объединены и вновь поделены на две части, одна состояла из евреев Латвии, вторая - из евреев Рейха. Сам процесс разделения привел к напряжённым отношениям между двумя группами.
В течение лета 1942 года немцы перевели некоторых евреев из гетто в концлагерь Кайзервальд. В ноябре того же года впервые были произведены акции в гетто и местах, где работали евреи. К концу декабря гетто было полностью уничтожено.
В 1944 году оставшихся в живых евреев Риги насильно заставили выполнять работы по вскрытию массовых захоронений и сжиганию тел, чтобы скрыть свидетельства массовых убийств (см. также Операция 1005). После окончания работ они также были уничтожены. В июне 1944 года немцы убили множество узников концлагеря Кайзервальд и соседних вспомогательных лагерей. Оставшиеся в живых евреи были депортированы в концлагеря за пределами Латвии.
Советские войска освободили Ригу 13 октября 1944 года. Несколько дней спустя на свободу из укрытий вышли 150 оставшихся в живых евреев.
Encyclopedia of the Holocaust, In Association with Yad Vashem, The Holocaust Martyrs' and Heroes' Remembrance Authority, Dr. Robert Rozett and Dr. Shmuel Spector, Editors, Yad Vashem and Facts On File, Inc., Jerusalem Publishing House Ltd, 2000.