המכון הבין-לאומי לחקר השואה

ערב הכיבוש הגרמני התגוררו בווקשנה כ-600 יהודים. רובם התפרנסו ממלאכה, מסחר וחקלאות. במקום פעלו בתי ספר של רשת "תרבות" ושל יבנה ובלטה השפעתן של מפלגות ציוניות. בעקבות סיפוח ליטא לברית-המועצות ב-1940 הולאמו כמה בתי עסק וחנויות ונאסרה פעילותן של מפלגות ותנועות נוער יהודיות.
עם פלישת הגרמנים לליטא ב-22 ביוני 1941 השתלטו על וקשנה לאומנים ליטאים. בתחילת יולי רוכזו הגברים היהודים בבנין בית המדרש וב-7 ביולי, לאחר סדרה של מעשי התעללות והשפלה, הועברו למחסני תבואה, וארבעה שבועות הוחזקו שם מעונים ומורעבים והועסקו בעבודות כפייה. כעבור ימים אחדים הועברו לשם גם אסירים פוליטיים, ובהם יהודים, ושלושה מהם נרצחו ב-20 ביולי.
במקביל רוכזו הנשים והילדים בבית המדרש והוחזקו שם שבועות מספר בתנאים קשים שגרמו תחלואה רבה. בקרבת בית המדרש הוקם בית חולים פרימיטיבי כדי לסייע להם. הנשים סבלו בבית המדרש התעללות קשה.
בסוף יולי או בראשית אוגוסט ערכו ליטאים רישום של הגברים היהודים במחסנים ושל הנשים בבית המדרש.
ב-4 באוגוסט 1941 הועברו יהודי וקשנה לעיר המחוז מז'ייק, רוכזו בבית הקברות המקומי, ונרצחו שם עם יהודי המקום והסביבה.